文件名称:xcmsrocker:用于代谢组学数据分析的Rocker图像
文件大小:102KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-03-05 00:09:49
docker r metabolomics R
xcmsrocker 摇杆图像用于代谢组学数据分析 对于Java,您可以选择 。 对于C / C ++,您可以选择或 。 对于C#,您可以选择 。 对于Matlab,您可以选择 。 对于python,您可以选择或 。 但是,我建议初学者使用该基于R的图像,希望我们将来能够看到Julia平台。 相同的软件并不是最终目标,详细的工作流程将是代谢组学研究中可重复研究的关键。 Xcmsrocker是基于Linux的docker映像,用于简单地使用基于R的代谢组学软件。 它包括多个代谢组学研究中使用的主流R软件包,以RStduio作为IDE。 这样的映像可以很容易地部署在移动中的单机或群集上。 为了使用户对代谢组学研究做正确的事,此图像中附加了rmwf软件包,以提供详细的工作流程模板(文件-新文件-R Markdown-从模板-选择带有{rmwf}的模板)并方便用户进行代谢组学进行数据
【文件预览】:
xcmsrocker-master
----.gitignore(50B)
----README.md(9KB)
----.gitmodules(558B)
----verse_xcms_withoutrmwf()
--------Dockerfile(666B)
----shiny_pmd()
--------Dockerfile(252B)
--------docker-compose.yml(1KB)
--------apps()
----xcmsrocker.Rproj(203B)
----verse_xcms()
--------Dockerfile(115B)
----CBverse_xcms()
--------Dockerfile(768B)
----downverse()
--------Dockerfile(426B)
----shiny_xcms()
--------Dockerfile(387B)
--------docker-compose.yml(1KB)
--------apps()