bioc4010:温莎大学BIOC-4010干实验室课程的资源文件文件

时间:2024-04-14 06:41:21
【文件属性】:

文件名称:bioc4010:温莎大学BIOC-4010干实验室课程的资源文件文件

文件大小:493KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-04-14 06:41:21

bioinformatics beginner-project teaching-materials Shell

BIOC-4010资源 该存储库包含加拿大温莎大学2021W学期BIOC-4010干实验课程的代码和文件。 这些代码是针对Windows 10虚拟机(VM)量身定制的。 请记住,重新启动VM后,所做的所有更改都将丢失,您将不得不再次进行设置。 文件是根据教程会话进行组织的,每个文件夹都有一个README.md文件,该文件在必要时提供特定于会话的说明。 在开始使用本教程中的数据之前,请访问相应的文件夹。 内容应与幻灯片文件一起使用,并提供给学生作业。 要下载文件,请在VM中启动Ubuntu终端,然后运行以下不以井号#开头的命令: git clone https://github.com/tongalumina/bioc4010.git cd bioc4010 # this following does not seem to be neccessary # chmod u+x set


【文件预览】:
bioc4010-main
----tut4()
--------getpdb.sh(370B)
--------sars.pml(254B)
--------README.md(3KB)
--------setup.sh(69B)
--------1UBQ.pdb(78KB)
----tut1()
--------assignment1.md(1KB)
--------setuptut1.sh(366B)
--------README.md(265B)
--------fasta.tgz(308KB)
----tut5()
--------USP8_Ensembl.meg(56KB)
--------usp8.meg(61KB)
--------USP8_Ensembl.mtsx(46KB)
--------usp8.mdsx(67KB)
--------USP8.mas(4KB)
--------USP8_Ensembl_model.txt(139KB)
--------MEGAX.md(2KB)
--------USP8.fa(48KB)
----LICENSE(7KB)
----tut2()
--------P04637.fasta(490B)
--------O15350.fasta(728B)
--------Q9BYF1.fasta(915B)
--------wdr5.fa(12B)
--------tpa.fa(12B)
--------P00750.fasta(669B)
--------PAM250(2KB)
--------BLOSUM80(2KB)
--------Q9HCU5.fasta(533B)
--------p73.fa(12B)
--------BLOSUM60(2KB)
--------Q3H3D4.fasta(772B)
--------preb.fa(12B)
--------ace2.fa(12B)
--------PAM100(2KB)
--------P61964.fasta(435B)
--------p53.fa(12B)
--------P00748.fasta(712B)
--------README.md(2KB)
--------f12.fa(12B)
--------p63.fa(12B)
--------BLOSUM30(2KB)
--------BLOSUM45(2KB)
----tut3()
--------3ogq.water(1KB)
--------ritonavir.pdbhits(80B)
--------rit-target.fa(4KB)
--------nosplitusp.fa(30KB)
--------3ogq.blastp(2KB)
--------ritonavir.pdbinfo(16KB)
--------allusps.fa(58KB)
--------lopinavir.pdbhits(65B)
--------3ogq.needle(1KB)
--------README.md(2KB)
--------4l1a.fa(106B)
--------ab1-target.fa(1KB)
--------3ogq.fa(123B)
--------lopinavir.pdbinfo(12KB)
--------usp9xcd.fa(465B)
----README.md(1KB)
----setup.sh(537B)

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