文件名称:RNAseqR:RNA-seq表达分析工具-开源
文件大小:16.67MB
文件格式:GZ
更新时间:2024-05-18 14:16:00
开源软件
RNAseqR专为RNA-seq数据的表达分析而设计,最适合分析多个未复制的文库。 它是当前为Linux系统编译的C ++编码程序。 借助GUI和命令行界面,它可以使用负二项式累积分布函数(CDF)或R检验统计量进行log,PPM和/或RPKM(如果提供了长度)转换,以及对差异表达进行统计分析。由Stekel等人介绍用于EST分析。 输出允许根据CDF概率,最高R值或R值与随机数据的比较做出决策。 比较是Stekel等人的可信度度量,或者是在给定的平均表达下观察到的R与预期的R。 随机化是通过泊松或负二项式分布或列改组进行的。