文件名称：PaintSHOP_pipeline:可扩展的机器学习管道，用于探针特异性预测
文件大小：12MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-31 20:05:52
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PaintSHOP管道 概述 是一项能够在基因组和转录组规模上进行寡核苷酸FISH实验的交互式设计的技术，它包含两个组件： 可扩展的机器学习管道，用于探针特异性预测 用于探针设计的交互式Shiny Web应用程序 该存储库包含用于机器学习管道的Snakemake工作流程，以及为Web应用程序上尚未托管的其他基因组设计探针所需的完整软件堆栈。 安装 确保已安装 。 克隆此仓库，然后创建并激活提供的： $ git clone https://github.com/beliveau-lab/PaintSHOP_pipeline.git \ && cd PaintSHOP_pipeline/ \ && conda env create -f environment.yml \ && conda activate paintshop_snakemake 运行管道 包括一个