【文件属性】：
文件名称：genepattern-notebook:将基因组分析与Jupyter Notebook集成的平台
文件大小：634KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-01 02:35:27
python bioinformatics jupyter reproducible-research nbextension
GenePattern笔记本
环境使GenePattern用户能够将文本，图形和代码与其GenePattern分析进行交织，以创建可编辑，共享和发布的“笔记本”。 GenePattern笔记本基于环境构建并对其进行扩展，因此用户无需编写代码即可利用其易用性和封装整个科学研究叙述的能力。
寻找JupyterLab支持？
目前，JupyterLab支持处于测试阶段。 您可以在其自己的分支中找到它。
安装
上详细介绍了供临时使用的完整安装说明。 用户还应考虑使用，该提供了GenePattern Notebook环境的免安装云部署。
开发安装
以下安装说明适用于希望从PIP或GitHub安装项目以进行软件开发的开发人员。
安装Python
为了使GenePattern Notebook工作，您首先需要安装兼容版本的Python。 这意味着您将需要Python 3.6+。 我们建议使用Anac
【文件预览】：
genepattern-notebook-master
----setup.py(2KB)
----genepattern.json(60B)
----.gitignore(23B)
----webpack()
--------webpack.config.js(1KB)
--------index.js(735B)
--------README.md(212B)
----.travis.yml(1KB)
----MANIFEST.in(67B)
----setup.cfg(39B)
----LICENSE.txt(2KB)
----.gitmodules(80B)
----README.md(7KB)
----Code_of_Conduct.md(2KB)
----DEPLOY.md(2KB)
----genepattern()
--------local_widgets.py(806B)
--------__init__.py(786B)
--------static()
--------jupyter_extensions.py(2KB)
--------remote_widgets.py(6KB)
----test()
--------test_widgets.py(194B)