文件名称：igv-jupyter:集成了igv.js的Jupyter Notebook扩展
文件大小：398KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-20 19:42:01
Python
igv Jupyter扩展 igv-jupyter是的扩展，其中包含 使用此扩展，您可以在单元格中渲染igv.js并从笔记本中调用其API。 该扩展程序公开了一个模仿igv.js浏览器创建和控制API的python API。 字典用于浏览器和跟踪配置对象。 跟踪数据可以从本地或远程URL加载，也可以直接作为对象列表提供。 注意：该项目支持经典笔记本。 有关启用了JupyterLab的扩展，请参见 。 安装 要求： python> = 3.6.4 jupyter> = 4.2.0 pip install igv-jupyter # To install to configuration in your home directory jupyter serverextension enable --py igv jupyter nbextension install --py igv
【文件预览】：
igv-jupyter-master
----setup.py(1KB)
----igv.json(57B)
----.gitignore(193B)
----LICENSE.md(1KB)
----MANIFEST.in(221B)
----postBuild(161B)
----setup.cfg(39B)
----examples()
--------Embeded-DataURI.ipynb(12KB)
--------GATK-gvcf.ipynb(2KB)
--------data()
--------LocalFiles.ipynb(2KB)
--------EmbeddedFeatures.ipynb(3KB)
--------RemoteFiles.ipynb(2KB)
--------BamFiles.ipynb(2KB)
--------Events.ipynb(2KB)
----igv()
--------.gitignore(14B)
--------__init__.py(505B)
--------static()
--------browser.py(6KB)
----README.md(5KB)
----deploy.md(436B)
----dev_install.sh(190B)