文件名称：TrAEL-seq：TrAEL-seq手稿使用的软件集合
文件大小：10KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-10 14:16:09
Python
特雷尔序列 TrAEL-seq的脚本和信息的集合。 2020年7月21日最新更新 TrAEL-seq预处理（UMI和Poly-T处理） 原始TrAEL-seq FastQ读取应具有以下结构： barcode (UMI) (8bp) // PolyT // Insert 步骤1： 脚本TrAELseq_preprocessing.py删除了读取的前TrAELseq_preprocessing.py （UMI），并将序列添加到readID的末尾（用冒号分隔，例如:UMISEQUENCE ）。 质量信息将被丢弃。 readID中的空白用_代替，以在映射后保留UMI序列。 第2步： 移动UMI序列后，脚本会在序列开始时查找最多3 T，然后删除这些序列。 在5'端具有超过3个Ts的序列最多被剪短3个TTT。 此预处理脚本需要Python 3。 该脚本以其当前