文件名称:DREAMM:使用整体机器学习预测蛋白质膜界面
文件大小:37.64MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-04-01 16:48:20
HTML
关于梦 DREAMM使用集成机器学习为外围膜蛋白提供了快速,可靠的蛋白膜界面预测。 入门 先决条件 我们建议在您的计算机上安装Miniconda,以更好地管理python软件包和环境。 我们建议在新的conda环境中安装DREAMM(请参阅)。 由于DREAMM还利用用Java编写的进行特征提取,因此还必须在您的计算机上安装Java。 最后,您必须下载数据库,这对于生成保护评分是必要的(可能需要一段时间才能下载)。 安装 创建一个新的conda环境,安装所有必需的python库 conda create -n dreamm moleculekit htmd-pdb2pqr biopython prody mdanalysis scikit-learn dssp msms hhsuite lightgbm mlxtend -c acellera -c anaconda -c insi