W301水分子在HIV-1蛋白酶和配体ABT-538结合中作用的QM/MM研究* (2008年)

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文件名称：W301水分子在HIV-1蛋白酶和配体ABT-538结合中作用的QM/MM研究* (2008年)
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更新时间：2021-06-01 12:53:09
自然科学 论文 结晶水分子W301在几乎所有的HIV-1蛋白酶(HW-1 PR)和配体的晶体结构中出现．在HIV-1 PR中A链天门冬氨酸残基Asp25质子化状态或B链Asp25质子化状态下，QM/MM模拟后MM-GBSA方法计算得到W301水分子在HIV-1 PR/ABT-538结合中的*能贡献分别为-16.88 kJ/mol、-17.63 kJ/mol，W301水分子在HIV-1 PR/ABT-538的结合中起到了关键的作用．进一步分析发现W301水分子与HIV-1 PR和ABT-538分别形成了两个、四个氢键．