【文件属性】：
文件名称：PPI型关系提取器：蛋白质之间的关系提取，蛋白质相互作用以及提取中的强类型PPI关系。.我的研究主题..正在进行的工作
文件大小：4.1MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-02-21 10:56:59
JupyterNotebook
PPI类型关系提取
蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）在细胞生物学的各个方面都起着非常重要的作用（Zhou＆He，2008）。 PPI相互作用形成复杂的网络，可以表示为图形，其中每个节点代表一种蛋白质，一条边代表两种蛋白质之间的关系类型。 通过阅读期刊来手动管理这些网络并定期向其提供最新信息已经超出了人类的寿命（Baumgartner，Cohen，Fox，Acquaah-Mensah和Hunter，2007年）。
任务定义
例如，在句子“全长cPLA2在体外被p42丝裂原活化蛋白（MAP）激酶化学计量磷酸化”，
蛋白质名称识别阶段将“ cPLA2”和“ p42丝裂原激活的蛋白质（MAP）激酶”识别为蛋白质名称。 一些实体识别任务还涉及识别实体角色，例如以“ cPLA2”为主题或目标蛋白，以“ p42丝裂原活化蛋白（MAP）激酶”为试剂蛋白或相互作用源。
蛋白质-蛋白质相互作用提取任务将“