文件名称：ppi-aimed:目的蛋白蛋白质关系提取
文件大小：25KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-03 23:54:09
Python
目的蛋白相互作用 目的蛋白蛋白质关系提取 下载AIMed数据集 从ftp://ftp.cs.utexas.edu/pub/mooney/bio-data/interactions.tar.gz下载 使用说明将原始数据集转换为XML convert_aimed.py -i aimed_interactions_input_dir -o aimed.xml 跑 步骤1：将xml AIMed转换为扁平化的json python src/preprocessors/aimed_json_converter.py --inputfile tests/sample_data/aimed.xml --outputfile aimed.json
【文件预览】：
ppi-aimed-main
----.travis.yml(207B)
----tests()
--------sample_data()
--------tests_preprocessors()
--------__init__.py(0B)
--------requirements.txt(26B)
--------tests_dataset()
----LICENSE(1KB)
----src()
--------preprocessors()
--------requirements.txt(44B)
--------datasets()
----.gitignore(2KB)
----README.md(561B)
----sagemaker.ipynb(19KB)