snakefmt:毫不妥协的Snakemake代码格式化程序

时间:2024-03-06 09:47:40
【文件属性】:

文件名称:snakefmt:毫不妥协的Snakemake代码格式化程序

文件大小:68KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-03-06 09:47:40

python formatter fmt bioinformatics snakemake

蛇形 该存储库提供文件的格式。 它遵循的设计和规格。 :warning_selector: 警告 :warning_selector: :默认情况下, snakefmt会snakefmt修改文件,因此我们强烈建议您在进行任何格式化之前,确保文件受版本控制。 您也可以从stdin中输入文件,这会将文件打印到屏幕上,或者使用--diff或--check选项。 有关更多详细信息,请参见。 目录 安装 皮皮 pip install snakefmt conda conda install -c bioconda snakefmt 货柜 码头工人 docker pull snakemake/snakefmt docker run -it snakemake/snakefmt snakefmt --help 您可以在找到所有可用的标签。 奇点 URI= " docker://snakemake/snakefmt " singularity exec " $


【文件预览】:
snakefmt-master
----codecov.yml(606B)
----.flake8(112B)
----.github()
--------CODEOWNERS(46B)
--------workflows()
----poetry.lock(57KB)
----Dockerfile(392B)
----plugin()
--------snakefmt.vim(3KB)
----CONTRIBUTING.md(1KB)
----LICENSE(1KB)
----README.md(12KB)
----.pre-commit-hooks.yaml(212B)
----Makefile(2KB)
----docs()
--------editor_integration.md(4KB)
----tests()
--------test_formatter.py(29KB)
--------test_config.py(10KB)
--------test_parser.py(10KB)
--------test_diff.py(3KB)
--------__init__.py(340B)
--------test_snakefmt.py(14KB)
--------test_grammar.py(1KB)
--------conftest.py(168B)
----.gitignore(2KB)
----snakefmt()
--------exceptions.py(567B)
--------logging.py(1KB)
--------config.py(3KB)
--------formatter.py(12KB)
--------__init__.py(333B)
--------types.py(2KB)
--------__main__.py(100B)
--------snakefmt.py(10KB)
--------parser()
--------diff.py(1014B)
----pyproject.toml(1KB)
----CHANGELOG.md(5KB)

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