文件名称：metscale:大都会规模
文件大小：80.62MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-06 20:35:05
open-source metagenomics taxonomic-classifications snakemake-workflows Python
MetScale：开源宏基因组学工作流程 这些开源宏基因组学工作流程旨在分析复杂环境样品的生物成分。预期的输入是端对端的Illumina FASTQ文件，当前的输出包括已过滤的读数，组合的重叠群，FastQC和QUAST结果的MultiQC报告，元基因组比较估计，分类学分类和功能预测。 入门 该项目的提供了有关安装和运行工作流程的有用说明。 先决条件 这些工作流已经过测试，可以在Linux操作系统（包括CentOS，Red Hat和Ubuntu）上脱机运行。 示例数据 工作流已使用来自该出版物的二次抽样数据集进行了测试： 最初的Shakya等。 2013数据集可作为在线。在我们的宏基因组学工作流程中，作为默认示例使用的二次抽样数据集可以在此处下载： 贡献 请阅读了解有关我们的行为准则以及如何为该项目做出贡献的详细信息。 执照 该软件已获得。 致谢 该项目以中开始的工作为。工作流中使用了各种