somatic-sniper:调用体细胞单核苷酸变异体的工具

时间:2024-06-03 15:29:46
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文件名称:somatic-sniper:调用体细胞单核苷酸变异体的工具

文件大小:1.93MB

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更新时间:2024-06-03 15:29:46

C

体力狙击手 该程序的目的是识别在肿瘤和正常人(或理论上,任何两个bam文件)之间不同的单核苷酸位置。 它需要一个肿瘤bam和一个正常bam,然后将两者进行比较以确定差异。 完整的文档可在项目或随附的。 执照 SomaticSniper是根据获得。 文献资料 用户支援 请首先搜索 ,然后在需要时在此处提问。 我们会自动监控是否有与我们的工具有关的问题。


【文件预览】:
somatic-sniper-master
----.gitignore(242B)
----gmt()
--------documentation.md(9KB)
--------install.md(3KB)
--------index.html(1KB)
--------gmt_somatic_sniper_16.png(819B)
--------gmt_somatic_sniper_48.png(5KB)
----version()
--------version.h.in(251B)
----gmt-web()
--------.gitignore(10B)
--------build(1KB)
--------common.yml(485B)
--------content()
----src()
--------exe()
--------scripts()
--------lib()
----integration-test()
--------data()
--------test_sniper.py(764B)
--------CMakeLists.txt(62B)
----.gitmodules(98B)
----COPYING(20B)
----debian()
--------postinst.in(1KB)
--------prerm.in(1KB)
----PackageInfo.cmake(2KB)
----README.md(871B)
----cmake()
--------BuildSamtools.cmake(2KB)
----vendor()
--------zlib-1.2.8.tar.gz(558KB)
--------samtools-0.1.6.tar.gz(359KB)
--------samtools.patch(424B)
----build-common()
--------.gitignore(6B)
--------bin()
--------resources()
--------python()
--------cmake()
--------vendor()
----docs()
--------sniper_manual.lyx(24KB)
--------copyright(1KB)
--------sniper_manual.pdf(75KB)
--------CMakeLists.txt(309B)
----gmt.yml(307B)
----test()
--------lib()
----CMakeLists.txt(2KB)

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