NUKE-BREAK:自动检测秀丽隐杆线虫种系的细胞核和DNA损伤

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文件名称：NUKE-BREAK:自动检测秀丽隐杆线虫种系的细胞核和DNA损伤
文件大小：292KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-04-29 03:56:00
imagej biology detection dna high-throughput 自动检测秀丽隐杆线虫种系的细胞核和DNA损伤 ImageJ程序（ ）的NUKE-BREAK宏是专门为检测线虫性腺中核内RAD-51病灶而开发的，但可用于检测和计数任何类型的圆形颗粒。 该宏旨在自动检测和处理该器官的一批显微镜堆栈（.tif）采集。 为此，已经针对性腺的有丝分裂和减数分裂区域优化了用于核和病灶检测的关键参数（最小和最大表面以及圆形度）。 宏将创建.tif堆栈列表，以便从根文件夹进行分析，并按以下方式进行处理： 使用预先存在的蓝色和红色LUT自动分配DAPI和RAD-51染色通道。 然后使用独立消除两个通道的噪声。 然后，通过组合和使用DAPI通道检测图像中的Gonad。 对Gonad的进一步分析可以自动检测其方向和远端位置。 每个核的位置将使用该参考点进行计算。 然后通过使用“默认”算法对每个切片对存在于Gonad中的像素值进行阈值检测来检测核。 由于原子核存在于

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NUKE-BREAK-master
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