【文件属性】：
文件名称：aRchaic:DNA损伤模式的探索，聚类，可视化和分类
文件大小：7.3MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-28 04:37:40
visualization clustering exploratory-data-analysis ancient-dna-sequences dna-damage
古老
一个R包，用于DNA损伤模式的探索，聚类和可视化。
作者
， ， ，
安装
首先，要求用户安装
还有Python包，
aRchaic要求R版本必须为3.4或更高。 如果您的R版本低于该版本，请升级。
完成这些步骤后，启动一个新的R会话并安装aRchaic：
install.packages("remotes")
remotes::install_github("kkdey/aRchaic")
现在您应该能够将Rchaic加载到R中。
library(aRchaic)
教程
从开始一个简短的教程
支持
创建新来报告错误和/或请求功能。
联系Kushal Dey（ kkdey@uchicago.edu ）或Hussein Al-Asadi（ halasadi@uchicago.edu ）
也欢迎用户通过提交拉取请求为软件包做出贡献。
引文
Al-Asadi，H.
【文件预览】：
aRchaic-master
----vignettes()
--------logo_design.svg(18KB)
--------vignette_fig.png(95KB)
--------archaic.Rmd(6KB)
--------fig.001.png(179KB)
----NAMESPACE(434B)
----DESCRIPTION(1KB)
----inst()
--------.DS_Store(6KB)
--------images()
--------extdata()
----R()
--------archaic_pool.R(4KB)
--------data.R(331B)
--------archaic_prepare.R(16KB)
--------archaic_plot.R(32KB)
--------archaic_fit.R(9KB)
--------filter_signatures_only_location.R(1KB)
--------archaic_view.R(29KB)
--------decompose_theta.R(4KB)
----.Rbuildignore(51B)
----aRchaic.Rproj(342B)
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--------archaic_view.Rd(1KB)
--------filter_signatures_only_location.Rd(936B)
--------archaic_pool.Rd(940B)
--------archaic_prepare.Rd(2KB)
--------archaic_plot.Rd(3KB)
--------decompose_theta.Rd(1KB)
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--------base_probs_moderns.Rd(797B)
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