文件名称：FHiTINGS:用于 NGS 的真菌高通量分类鉴定工具-开源
文件大小：4.26MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-18 03:58:00
开源软件
FHiTINGS 旨在用于在 BLASTn 搜索后快速识别、分类和解析内部转录间隔 (ITS) DNA 序列。 该软件可用于使用下一代测序 (NGS) 进行真菌生态学研究。 有关更多信息，请参阅我们在 Journal of Basic Microbiology (http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jobm.201200507/pdf) 上的论文，如果您使用我们的程序，请引用该论文。 感谢您使用 FHiTINGS！ 注意：FHiTINGS 版本 1-4 已经发布。 这使用了 FHiTINGS 使用的 BLAST 数据库的更新。 另请注意，FHiTINGS 必须在 Python 2.4-2.7.1 上运行（它不会在 Python 3.0 或更高版本上运行）。 :copyright: 2012 凯伦丹尼米勒。 FHiTINGS 根据知识共享署名-相同方式共享 3.0 许可条款提供，http://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/。 其他相关项目：FHiTINGS 的曲霉数据库，http://sou
【文件预览】：
FHiTINGS_version_1-5_final
----fhitings.py(11KB)
----db.csv(1.65MB)
----FHiTINGS_Disclaimer.txt(1KB)
----FHiTINGS_Instructions_ver_1-5.pdf(242KB)
----UNITEdatabse_fhitingsformat_dynamic_s_02_02_2019.fasta(18.91MB)
----LocalBlastDatabaseCreation.txt(6KB)
----FHiTINGS_Creative_Commons_License.txt(17KB)