文件名称:crt:转录组分析脚本(历史上是临床研究转录组)
文件大小:18.06MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-05-28 13:51:55
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1.安装 将 , 和克隆到~/crt , ~/cre和~/bioscripts 。 设置PATH:在〜/ .bash_profile中export PATH=~/crt/scripts:~/cre/scripts:~/bioscripts/scripts 。 安装 ,设置PATH和PYTHONPATH: export PATH=/path/bcbio/anaconda/bin:$PATH export PYTHONPATH=/path/bcbio/anaconda/lib/python2.7 2.使用〜/ crt / config / crt.bcbio.default.yaml运行bcbio。 名称样本SX_case-N-组织,即S101_55-1-F。 创建项目/输入,项目= SX,输入文件[sample] _1.fq.gz,[sample] _2.fq.gz。 crt.p