文件名称:RSeQC:RNA-seq 数据,QC-开源
文件大小:99KB
文件格式:GZ
更新时间:2024-06-18 15:48:04
开源软件
RSeQC 提供了许多功能来评估 RNA-seq 数据的质量。 http://rseqc.sourceforge.net/
【文件预览】:
RSeQC-4.0.0
----MANIFEST.in(148B)
----PKG-INFO(724B)
----distribute_setup.py(15KB)
----setup.cfg(59B)
----doc()
--------THANKS(198B)
--------CONTACTS(68B)
--------INSTALL(1KB)
--------Manual(45B)
--------COPYING(833B)
----setup.py(2KB)
----lib()
--------qcmodule()
--------psyco_full.py(194B)
--------RSeQC.egg-info()
----scripts()
--------read_hexamer.py(3KB)
--------split_bam.py(5KB)
--------read_GC.py(2KB)
--------read_distribution.py(12KB)
--------read_duplication.py(2KB)
--------inner_distance.py(4KB)
--------read_quality.py(3KB)
--------infer_experiment.py(5KB)
--------RNA_fragment_size.py(5KB)
--------junction_saturation.py(4KB)
--------clipping_profile.py(3KB)
--------bam2fq.py(3KB)
--------bam2wig.py(5KB)
--------geneBody_coverage.py(11KB)
--------divide_bam.py(2KB)
--------RPKM_saturation.py(7KB)
--------bam_stat.py(2KB)
--------mismatch_profile.py(3KB)
--------junction_annotation.py(6KB)
--------tin.py(11KB)
--------FPKM-UQ.py(7KB)
--------normalize_bigwig.py(6KB)
--------split_paired_bam.py(5KB)
--------geneBody_coverage2.py(6KB)
--------deletion_profile.py(3KB)
--------insertion_profile.py(2KB)
--------FPKM_count.py(13KB)
--------overlay_bigwig.py(3KB)
--------read_NVC.py(3KB)