SatIntExt:卫星内部和外部Illumina读数的分析

时间:2024-04-27 00:08:30
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文件名称:SatIntExt:卫星内部和外部Illumina读数的分析

文件大小:40KB

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更新时间:2024-04-27 00:08:30

SatIntExt 卫星内部和外部Illumina读数的分析 提取重复元素的内部和外部读取对的协议 内部读取对:两个成员都与同一重复元素具有同源性。 它们应该位于satDNA阵列内。 外部读对:一个与重复元件同源的成员,另一个与另一个重复元件同源的成员。 一个读数应该位于satDNA阵列内部,而另一个读数应该位于satDNA阵列外部。 0.随机读取 带有读操作的FASTA文件应混洗。 您可以使用: $ shuffleSequences_fasta.pl file_1.fasta file_2.fasta file_12.fasta 一种替代方法是使用: $ rexp_prepare_normaltag.py FASTA文件应如下所示: >seq1/1 AAAAAA >seq1/2 AAAAAA >seq2/1 AAAAAA >seq2/2 AAAAAA [...]


【文件预览】:
SatIntExt-main
----internal_external_read_pairs.png(41KB)
----LICENSE(1KB)
----README.md(962B)

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