icml18-jtnn:用于分子图生成的连接树变分自动编码器(ICML 2018)

时间:2024-06-02 00:47:08
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文件名称:icml18-jtnn:用于分子图生成的连接树变分自动编码器(ICML 2018)

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更新时间:2024-06-02 00:47:08

Python

交会树变分自编码器用于分子图生成 结点树变分自动编码器的正式实现 更新 我们已经对JT-VAE进行了架构改进。 我们建议您在上检查我们的新存储库。 此回购包含在ChEMBL(180万个化合物)上预先训练的分子语言模型和用于属性指导的分子生成的脚本。 所有脚本均使用python 3.7和pytorch编写。 加速版 我们已经加快了代码的速度! 新代码位于fast_jtnn/ ,而VAE培训脚本位于fast_molvae/ 。 有关详细信息,请参阅fast_molvae/README.md 。 要求 Linux(我们仅在Ubuntu上进行了测试) RDKit(版本> = 2017.09) Python(版本== 2.7) PyTorch(版本> = 0.2) 要安装RDKit,请按照的说明进行操作 我们强烈建议您使用conda进行软件包管理。 快速开始 以下目录包含我们模型的最新实现:


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