PepDistiller:用于验证吉祥物结果的肽段鉴定的软件-开源

时间:2024-05-20 11:28:09
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文件名称:PepDistiller:用于验证吉祥物结果的肽段鉴定的软件-开源

文件大小:4.43MB

文件格式:7Z

更新时间:2024-05-20 11:28:09

开源软件

在这项研究中,我们提出了一个名为PepDistiller的质量控制工具,以帮助验证MASCOT搜索结果。 通过包括胰蛋白酶末端的数量,并整合完善的错误发现率(FDR)计算方法,我们证明了从半胰蛋白酶搜索结果中获得的肽段鉴定具有更高的敏感性。 根据对复杂数据集的分析,使用PepDistiller比使用MASCOT Percolator获得的肽鉴定大约多7%。 此外,改进的方法所产生的FDR估算值比Percolator中应用的不正确目标(PIT)固定方法百分比低。 使用标准数据集,我们进一步证明了精确的FDR估计相对于PIT固定的FDR估计具有更高的准确性。 PepDistiller使用方便快捷,可免费使用以供学术访问。 也可以从http://www.bprc.ac.cn/pepdistiller下载该软件。


【文件预览】:
PD_1_28_release_20140702
----config.default.feature(22B)
----core_1_28.exe(7.25MB)
----SSPercolator.exe(391KB)
----PepDistiller1_28.exe(7.34MB)
----percolator.exe(591KB)
----inetpub()
--------mascot()

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