文件名称：matlab集成c代码-TFCompetitionCode:Waymack等人在2021年用于分析和图形生成的代码
文件大小：254KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-10 21:59:13
系统开源
Matlab集成的c代码TFCompetitionCode 在Waymack等人（2021年）中用于分析报告子表达，建模TF结合概率以及生成图形的代码。Matlab分析转录报告子活性在运行任何报告子分析脚本之前，您首先需要使用LivemRNA来跟踪各个转录点可以在Github上找到该软件包，以及有关图像处理的尼康说明（）中有关这些脚本的说明。 为您制作并想要分析的每部电影填写DataStatus Excel工作表。 为每个结构创建一个单独的工作表，为该工作表命名该结构的名称。 B上的每一列都应填写单独的电影。 必须填写“前缀”行和“ CompileParticles”行，该影片的数据才能在以下任何脚本中使用。 在“前缀”行中填写“前缀=”，后跟您给该电影的名称。 例如：对于名为“ 2018-03-5-Kr1_Kr1”的电影，“前缀”行应填写为：前缀=“ 2018-03-05-Kr1_Kr1”要在分析中使用胚胎的数据，必须将CompiledParticles行设置为如Waymack等人（2021年）所述，填写“ ApproveAll”正在运行的“ RW”脚本以编译和绘制数据： 运行“ R
【文件预览】：
TFCompetitionCode-main
----CompitionLevels_BootStrap_RW.m(11KB)
----LICENSE(34KB)
----RunBurstPropertiesSlope.m(2KB)
----ReporterDistDistribution_RW.m(17KB)
----README.md(6KB)
----TotalExpressionLevels_RW.m(25KB)
----Clean pBound Analysis.ipynb(389KB)
----NegCovarRatesRW.m(18KB)
----RunComparingSpotCorrAdjRW.m(2KB)
----APExpressionBoundsRW.m(16KB)