文件名称：KEGGParser：在 Matlab 中解析和编辑 KEGG 通路图：用于 KEGG 通路解析、编辑、可视化和分析的基于 Matlab 图形的工具-matlab开发
文件大小：5.31MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-19 05:15:12
matlab
KEGG 通路数据库是一组手动绘制的通路图，代表分子相互作用和React网络的当前知识，并附有 KGML（KEGG 通路 xml 格式）文件，用于代谢和信号网络的自动计算分析和建模。 在 KGML 文件中，路径被表示为一个图形对象，入口元素（基因产物、化合物、路径）作为它的节点，元素之间的关系作为边。 然而，在大多数情况下，路径的静态图像和伴随的 KGML 文件之间缺乏对应关系，因此需要对 KGML 文件中包含的信息进行预处理，然后才能将其用于自动分析。 最近开发了几个 KGML 解析器，独立的或集成在不同的生物信息学包中。 我们介绍基于Matlab传记类的KEGGParser（路径解析器/编辑器）。 特征： 1. 蛋白质-化合物-蛋白质相互作用、组节点和结合方向的检索、解析和自动校正； 2.基于“Graph操作”（ http://www.mathworks.com/matlabce
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Kegg_parser.zip
KEGG_parser.zip