GLnexus:可扩展的gVCF合并和联合变体,要求进行人口测序项目

时间:2021-05-10 14:10:50
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文件名称:GLnexus:可扩展的gVCF合并和联合变体,要求进行人口测序项目
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更新时间:2021-05-10 14:10:50
C++ 葛兰素史克 来自DNAnexus的研发:可扩展的gVCF合并和联合变异,要求进行人口测序项目。 (GL,基因型可能性) 读 与和合作者合作的详细介绍了GLnexus的设计和科学验证,使用了多达240,000个人类外显子组和22,600个基因组。 与用于此类大型项目的DNAnexus云原生部署相比,此开源版本产生相同的科学成果,但缺乏某些可伸缩性和面向生产的功能。 2020年的新功能: (由Google Health团队提供)进行包括带有1000个Genomes Project产品的。 Wiki页面上有针对初学者的教程。 对于每个标记的修订,“页面都有适合大多数Linux x86-64主机的静态可执行文件。 只需下载它,然后使用chmod +x glnexus_cli 。 每个版本还提供包装了glnexus_cli的轻量级Docker映像。 构建和测试 GLnexus的构建过程具有许多

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