SAT-Assembler:可扩展且准确的靶向基因组装,可用于大规模NGS数据-开源

时间:2024-05-20 12:16:07
【文件属性】:

文件名称:SAT-Assembler:可扩展且准确的靶向基因组装,可用于大规模NGS数据-开源

文件大小:32KB

文件格式:GZ

更新时间:2024-05-20 12:16:07

开源软件

SAT-Assembler是用于大规模RNA-Seq和宏基因组数据的可扩展且准确的基因组装工具。 与现有的基因组装工具相比,它可以从生物学家特别感兴趣的基因家族中回收基因,具有高覆盖率,低嵌合率和极低的内存使用率。 而且,它自然地与并行计算平台兼容。


【文件预览】:
SAT-Assembler
----chmod_scripts.sh(289B)
----DNA2Protein(28KB)
----hmmer3_pipeline_strand.sh(750B)
----check_python_packages.py(113B)
----assembler.py(82KB)
----manual.txt(2KB)
----parse_hmm_files.py(951B)
----SAT-Assembler.sh(2KB)
----Makefile(120B)
----DNA2Protein.cpp(7KB)

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