文件名称：gam-ngs:NGS基因组组装合并
文件大小：413KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-27 07:18:30
C++
##构建说明
###需要包装
gcc> = 4.4
cmake
zlib
提升库> = 1.44
谷歌稀疏哈希
注意：建议您安装以前版本软件包的最新版本。
###如何构建应用程序
$ cd gam-ngs
$ mkdir build
$ cd build
$ cmake ..
$ make
GAM-NGS的可执行文件放在“ bin”子文件夹中。
＃＃用法
###先决条件
对于每个程序集和每个读取库，GAM-NGS的输入都需要一个文件，其中列出了已对齐库的BAM文件。 该文件的格式必须如以下示例所示：
$ cat assembly.PE.bams.txt
/path/to/bam/file/master-pe-lib1.bam