文件名称：去噪代码matlab-Network_Filters:使用网络过滤器对大规模生物数据进行去噪
文件大小：27.88MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-16 01:45:50
系统开源
去噪声代码matlab 使用网络过滤器对大规模生物数据进行去噪 该代码复制了Kavran和Clauset 2020手稿中的数字。 运行说明 要运行所有脚本，请将此存储库中的所有目录（和子目录）添加到您的路径并执行“ run_all_scripts.m” 该代码使用统计工具箱在MATLAB R2016a上运行，并调用由其他人用C编写的社区检测代码。
【文件预览】：
Network_Filters-master
----.gitignore(58B)
----results()
--------Chung_Lu_Output()
--------Protein_Atlas_Output()
--------Community_Random_Graphs_Output()
----data()
--------id_uniprot_ensembl_map.csv(507KB)
--------cancer_data.csv(2.12MB)
--------cancerNames.txt(167B)
--------all_hint_nodes_names.csv(233KB)
--------healthy_tissue_average_list.xlsx(9KB)
--------edge_list.csv(580KB)
--------FoundComms1.tsv(90KB)
--------healthy_data.csv(910KB)
--------edge_list_for_dcsbm.txt(751KB)
----code()
--------HINT_data_wrangling.Rmd(14KB)
--------ChungLu_SyntheticData.m(5KB)
--------General_Network_Functions()
--------HINT_data_wrangling.nb.html(724KB)
--------human_protein_atlas_KNN.m(9KB)
--------run_all_scripts.m(70B)
--------Synthetic_Data_Functions()
--------Community_Random_Graphs.m(11KB)
--------KNN_Regression_Functions()
--------Network_Filter_Functions()
--------Newman_Clauset_Community_Detection()
----README.md(444B)
----raw_data()
--------HGNC_ensembl_names_from_atlas_as_input.txt(1.05MB)
--------healthy_tissue_v16.csv(69.58MB)
--------cancer_v16.csv(70.98MB)
--------cancer_tissues_metadata.csv(3.48MB)
--------ensembl_ids.txt(239KB)
--------healthy_tissues_metadata.csv(3.51MB)
--------HomoSapiens_binary_hq_downloaded_2019_04_13.txt(6.13MB)
--------edge_list.csv(580KB)