文件名称：biogas_metagenome_binning:perl脚本从元基因组装配中提取微生物基因组-开源
文件大小：137.72MB
文件格式：GZ
更新时间：2024-06-15 11:09:49
开源软件
shot弹枪读数的元基因组组装会产生大量来自社区中不同微生物基因组的支架。 装箱是对支架（或序列读数）进行分组并将其分配给操作分类单元的过程。 从分箱过程中提取的微生物基因组通常被称为“基因组箱”，以将其与从细菌克隆的测序和组装中获得的微生物基因组区分开。 在此项目中，我们报告了一组专门为分箱过程设计的perl脚本。 他们中的一些人被开发为以自动方式执行Albertsen和coll提出的程序。 （http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=23707974），另一些则是专门为新开发的分级策略而开发的，旨在简化数百个基因组的分级并评估其完整性。