文件名称：BRCA12_PrimaryRecurrent:主要循环手稿中使用的脚本
文件大小：85KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-04 12:06:33
R
BRCA12_PrimaryRecurrent 主要/循环手稿中使用的脚本
【文件预览】：
BRCA12_PrimaryRecurrent-main
----.DS_Store(10KB)
----LICENSE(34KB)
----README.md(71B)
----RNAseq()
--------01_getRNAreadcount.sh(1KB)
--------.DS_Store(10KB)
--------07_modules.R(13KB)
--------05_multivariate.R(14KB)
--------Differential_transcript_usage()
--------06_diffGenes.R(17KB)
--------00_getRNAreadcount.sh(993B)
--------02_runStringtie.sh(1KB)
--------08_functionalEnrichment.R(8KB)
--------03_TxImport_fromStringtie.R(3KB)
--------04_dataWrangling.R(8KB)
----.gitignore(570B)
----Somatic_mutations()
--------.DS_Store(8KB)
--------MutSigCV()
--------calculate_TMB.py(3KB)
--------Somatic_mutation_filtering()
--------GSEA_LoF_mutations()
----CNV()
--------CNV_annotation_GSEA()
--------.DS_Store(14KB)
--------HRD_Aneuploidy_scores()
--------GISTIC()