文件名称:RS-REMD_tutorial
文件大小:1.51MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-04-29 15:10:33
Python
RS-REMD教程 请引用以下文章: : 直到Siebenmorgen 脚本是用python 2.7编写的(适用于Amber用户) 要执行组文件的设置,请执行以下操作: python prepare_files_rs.py 修改Lennard-Jones参数: python lj.py parm.top 4 -d 0.00 0.1 0.2 0.5 -e 1.00 0.95 0.90 0.80 -c heating.rst -r:1-66 -l:67-123 -hMassRepartitioning -o system .top | tee lj.log 要开始模拟,请执行以下操作:源rs.run 有关lj.py的详细信息(python lj.py -help): parm.top | 您在系统之前创建的输入拓扑文件 4 | 您要使用的副本数,在本例中为4; 适用于8到1
【文件预览】:
RS-REMD_tutorial-main
----paper.pdf(2.22MB)
----Example_Preparation()
--------heated.rst(91KB)
--------parm.top(841KB)
--------lj.py(7KB)
--------remd.in(1KB)
--------prepare_files_rs.py(731B)
----README.md(2KB)