【文件属性】：
文件名称：readphaser:来自 HapCut 的实验性读取定相
文件大小：9KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-06-12 07:54:05
Python
readphaser -- 根据映射结果和 HapCUT 数据分离读取
注意事项： readphaser已在进行了使用测试并使用该项目的数据进行了基准测试。 在我们的测试中，它对许多具有足够密度的变体和覆盖范围的重叠群进行分阶段。 但是，它尚未在其他物种中进行广泛测试，您的里程可能会有所不同。 与所有生物信息学程序一样，检查您的结果是否与您自己的验证程序一致。 另外，我现在很忙，所以（与所有免费软件一样）无法保证支持，但我会尽力而为。
pr.py从和相应的 BAM 比对文件中获取分阶段变体以生成：
分阶段读取的 FASTA 文件（标题中包含定相块和单倍型）。
定相中未使用的读数的 FASTA 文件（例如，由于变异的同一位置的测序错误）。
来自未定相重叠群的读取的 FASTA 文件。
运行 ReadPhaser：
$ python pr.py -u unphased.fq -p
【文件预览】：
readphaser-master
----pr.py(15KB)
----README.md(1KB)
----hapcut.py(4KB)
----readset.py(4KB)