文件名称：AHRD:具有人类可读描述（HRD）和基因本体论（GO）术语的高通量蛋白质功能注释
文件大小：7.4MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-02 22:18:35
Java
自动分配人类可读描述（ AHRD ） 序列数据库中的简短描述对于快速了解有关序列的重要信息（例如在搜索结果中）很有用。 我们开发了一个名为“人类可读描述的自动分配”（ AHRD ）的新程序，旨在选择简洁，内容丰富且精确的描述和基因本体术语。 AHRD的性能优于竞争方法，并且可以克服由错误注释，缺少相似序列和部分比对引起的问题。 目录 制表符分隔表 Fasta格式 使用BLASTX结果运行AHRD 参数优化并行优化 计算所选参数集的F分数 算法 伪代码 使用的公式和参数 参数 控制表格序列相似性搜索结果表的解析的参数 控制基因本体术语注释的参数 优先选择参考蛋白作为具有GO Term注释的候选蛋白 自定义参考基因本体注释自定义基因本体数据库 测验 执照 作者 参考 1入门 1.1要求 AHRD是一个Java程序，需要Java 1.7或更高版本以及ant 。 1.2安装 1.2.1