文件名称：msmexplorer：用于生物分子动力学的数据可视化
文件大小：368KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-02-26 00:18:51
python markov-model data-visualization msmbuilder plotting
MSMExplorer：用于生物分子动力学的数据可视化 MSMExplorer是一个Python可视化库，用于生物分子动力学的统计模型。 它提供了一个高级界面，可使用绘制统计图形。 文献资料 在线文档可。 它包括IPython笔记本，详细的API文档以及其他有用的信息。 还有对于开发版本文档。 这些应该与github master分支相对应。 例子 from msmbuilder . example_datasets import FsPeptide from msmbuilder . featurizer import RMSDFeaturizer import msmexplorer
【文件预览】：
msmexplorer-master
----setup.py(2KB)
----.gitignore(119B)
----requirements.txt(71B)
----.travis.yml(950B)
----LICENSE(1KB)
----devtools()
--------travis-ci()
--------conda-recipe()
--------README.md(4KB)
--------conda-recipe-win()
----paper()
--------paper.template(7KB)
--------paper.pdf(194KB)
--------compile_paper.sh(140B)
--------paper.bib(5KB)
--------paper.md(2KB)
----.github()
--------PULL_REQUEST_TEMPLATE.md(213B)
----examples()
--------plot_timescales.py(1KB)
--------plot_angles.py(846B)
--------plot_implied_timescales.py(1KB)
--------plot_free_energy_1d.py(1KB)
--------plot_free_energy_2d.py(1KB)
--------plot_voronoi.py(449B)
--------colors.py(256B)
--------plot_decomp_grid.py(1KB)
--------plot_msm_network.py(1KB)
--------plot_chord.py(736B)
--------plot_trace2d.py(1KB)
--------plot_pop_resids.py(970B)
--------plot_trace.py(434B)
--------plot_histogram.py(776B)
--------plot_stackdist.py(1KB)
--------plot_tpaths.py(1KB)
----notebooks()
--------Fs-Peptide-Example.ipynb(9KB)
----README.md(6KB)
----msmexplorer()
--------palettes()
--------__init__.py(86B)
--------utils.py(4KB)
--------tests()
--------plots()
----appveyor.yml(390B)
----basesetup.py(12KB)
----docs()
--------.gitignore(75B)
--------installing.rst(2KB)
--------requirements.txt(124B)
--------Makefile(6KB)
--------api.rst(772B)
--------index.rst(3KB)
--------conf.py(10KB)
--------bibparse.py(2KB)
--------_static()
--------notebooks()
--------sphinxext()
--------changelog.rst(4KB)
--------papers_templ.rst(765B)
--------papers.bib(5KB)
--------contributing.rst(844B)