TRiP:核糖体分析工具

时间:2024-03-02 19:50:17
【文件属性】:

文件名称:TRiP:核糖体分析工具

文件大小:20.57MB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-03-02 19:50:17

Python

分步教程 欢迎使用TRiP工具教程! TRiP旨在执行从FastQ文件到差异表达分析的所有经典步骤的核糖体分析(RiboSeq)数据>分析。 [目录] 1)安装Docker 首先,Docker必须存在于19版或更高版本中。 如果您还没有,现在是时候修复它了! Docker Engine可通过Docker Desktop在不同的OS(如macOS和Windows 10)上使用,并且可作为多种Linux平台的静态二进制安装。 全部都可以在这里找到: : 提示: 对于Windows,也需要Microsoft商店应用程序中的WSL2和Ubuntu。 2)目录准备 TRiP不需要安装(yipee),但是需要精确的文件夹体系结构(boo)。 第一步是创建项目文件夹。 它被命名为您的项目,并将是链接到Docker的卷。 然后,必须分别创建和完成两个子文件夹和一个文件。 注意,这些步骤是进行


【文件预览】:
TRiP-master
----config.yaml(2KB)
----LICENSE(34KB)
----TRiP()
--------tools()
--------Snakefile(26KB)
--------Dockerfile(760B)
--------TRiP.sh(1KB)
--------all_TRiP.yml(13KB)
----README.md(13KB)
----transcriptome.zip(20.53MB)

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