文件名称：mQC：核糖体谱图质量控制工具
文件大小：174KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-02-26 12:06:56
python quality-control mapping perl ribosome-profiling
MappingQC（独立版） MappingQC是一种易于生成一些图形的工具，可以很好地概述核糖体图谱数据的映射质量。 更具体地说，它概述了P位点偏移的计算，基因分布和元基因分类。 此外，MappingQC对数据的规范转录本中的三重态周期和关联的三重态阶段（通常是核糖体分析）进行了彻底的分析。 特别地，考虑了相分布和RPF长度，相对序列位置和三联体同一性之间的联系。 例 主脚本是mQC.pl，您可以按照以下示例运行它： mQC.pl --experiment_name yourexperimentname --samfile yoursamfile.sam --cores 20 --spe
【文件预览】：
mQC-master
----mQC.pl(116KB)
----LICENSE(34KB)
----README.md(12KB)
----mqc_tools()
--------install_pyplot3D_mod.py(846B)
--------ENS_db.py(14KB)
--------codon_refs()
--------mQC.py(56KB)
--------quality_plots.R(2KB)
--------site-packages()
--------logo_mqc2_whitebg.png(95KB)
--------metagenic_piecharts.R(3KB)
--------simulate_utr_for_prokaryotes.py(3KB)