transrate-tools:读取bam文件并汇总有关序列的读取映射信息

【文件属性】：

文件名称：transrate-tools:读取bam文件并汇总有关序列的读取映射信息

文件大小：9KB

文件格式：ZIP

更新时间：2024-05-26 12:52:49

C++

转换工具 用于处理bam文件的命令行工具。 用C ++编写并使用Bamtools。 建造 transrate-tools使用C ++ 11功能，因此您至少需要安装g ++ 4.7。 在OSX上，您可以使用brew install gcc49安装最新的gcc。 请注意，在OSX上，您始终需要使用选项-DCMAKE_CXX_COMPILER=$(which g++-4.9)来告诉cmake在哪里可以找到gcc。 确保使用子模块克隆： $ git clone --recursive [e-mail]:cboursnell/transrate-tools.git 并且您将需要安装cmake。 接下来，构建bamtools： 在Linux上： $ cd bamtools $ mkdir build $ cd build $ cmake .. $ make $ cd ../..

【文件预览】：
transrate-tools-master
----.gitmodules(91B)
----src()
--------pileup.cpp(2KB)
--------pileup.h(1015B)
--------bam-read.h(503B)
--------bam-read.cpp(6KB)
--------CMakeLists.txt(558B)
--------segmenter.cpp(3KB)
--------segmenter.h(723B)
----CMakeLists.txt(1KB)
----bamtools()
----README.md(2KB)
----.gitignore(103B)