AnnotateGenomicRegions:Web应用程序注释基因组区域-开源

时间:2024-06-16 03:31:09
【文件属性】:

文件名称:AnnotateGenomicRegions:Web应用程序注释基因组区域-开源

文件大小:6.03MB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-16 03:31:09

开源软件

AnnotateGenomicRegions是一个基于Java的Web应用程序,可在用户提供的基因组区域列表中找到重叠和/或邻近的基因组注释。 与CisGenome,BedTools,Bioconductor ChIPpeakAnno或Galaxy等工具相反,该工具非常易于使用,不需要在用户计算机上下载和安装软件,也不需要注释软件的任何特定知识。 只需复制并粘贴您的区域,或浏览到包含您的基因组区域的本地文本文件。 数十万个基因组区域可以同时带有数十个已知的基因组注释。 输出以zip文件形式提供,其中包含制表符分隔的文本文件。 已为Glassfishv3开发了AnnotateGenomicRegions。


【文件预览】:
upload
----empty.txt(0B)
March2011
img
----Rita De Molfetta.png(50KB)
----Heiko Muller.png(49KB)
----Gabriele Bucci.png(54KB)
----Luca Zammataro.png(51KB)
----Arnaud Ceol.png(79KB)
META-INF
----MANIFEST.MF(106B)
prostate_adenocarcinoma.bed
WEB-INF
----beans.xml(274B)
----web.xml(4KB)
----src()
--------conf()
--------java()
----classes()
--------iit()
----glassfish-web.xml(854B)
----lib()
--------primefaces-3.4.1.jar(1.73MB)
--------commons-io-2.1.jar(159KB)
--------commons-io-2.1-javadoc.jar(686KB)
--------commons-fileupload-1.2.2.jar(58KB)
--------primefaces-3.4.1-sources.jar(1.58MB)
--------fdt.jar(785KB)
--------commons-io-2.1-sources.jar(230KB)
temp
----empty.txt(0B)
resources
----css()
--------gsnewsbar.css(4KB)
--------gsearch.css(38KB)
----js()
--------gsnewsbar.js(32KB)
--------api.js(24KB)
--------LoadNewsBar.js(615B)
menubar.xhtml
menu.xhtml
index.xhtml
download
----empty.txt(0B)
distance.xhtml
custom.xhtml
annotate.xhtml
results.xhtml
template.xhtml
news.xhtml
Sept2011
favicon.ico
Oct2012

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