MetaAnnotator:宏基因组读数的快速准确分类注释-开源

时间:2024-06-21 21:08:00
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文件名称:MetaAnnotator:宏基因组读数的快速准确分类注释-开源

文件大小:10.77MB

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更新时间:2024-06-21 21:08:00

开源软件

大家好。 NCBI 为其参考序列采用了一种新格式。 MetaAnnotator 目前无法在最新版本的 NCBI ref seq 上工作。 我会尽快更新程序。 您可以在此之前使用存档版本 ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/archive/old_refseq/Bacteria/all.fna.tar.gz。 分类注释是分析宏基因组数据的关键第一步。 尽管开发了很多工具,但性能(运行时间和准确性)仍然不能令人满意,特别是当数据库中不存在接近的物种级参考时。 我们提出了一种新的注释工具 MetaAnnotator,用于注释宏基因组学读取,当数据库中仅存在属级引用时,该工具显着优于所有现有工具。


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