文件名称:AGEpy:适用于Python的生物信息学工具
文件大小:2.21MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-06 17:40:51
Python
年龄 该python软件包包含由马克斯·普朗克衰老生物学研究所的生物信息学核心设施开发的生物信息学工具。 马克斯·普朗克衰老生物学研究所约瑟夫-斯泰兹曼大街9b D-50931科隆德国 阅读文档 安装 点子 最新点子发布: pip install AGEpy --user 的github 从github获取最新的开发版本: git clone https://github.com/mpg-age-bioinformatics/AGEpy 安装: cd AGEpy python setup.py install --user 然后根据需要通过以下方式更新到最新版本: cd AGEpy git pull python setup.py install --user --force 或者,您也可以使用符号链接安装软件包,以便对源文件的更改将立即对系统上的软件包用户可用:
【文件预览】:
AGEpy-master
----setup.py(1KB)
----.gitignore(194B)
----Dockerfile(259B)
----requirements.txt(165B)
----conf.py(133B)
----bin()
--------abed(1KB)
--------aDiff(25KB)
--------QC_plots(24KB)
--------blasto(10KB)
--------obo2tsv(6KB)
--------david(2KB)
----.travis.yml(111B)
----LICENSE(1KB)
----README.md(2KB)
----README.rst(496B)
----index.html(280B)
----mkdocs.yml(672B)
----docs()
--------executables()
--------index.md(1KB)
--------.DS_Store(6KB)
--------cookbook.md(470B)
--------modules()
----AGEpy()
--------bed.py(12KB)
--------AGEpy.py(376B)
--------kegg.py(16KB)
--------__init__.py(376B)
--------david.py(9KB)
--------go.py(3KB)
--------rbiom.py(3KB)
--------gtf.py(9KB)
--------meme.py(1KB)
--------sam.py(4KB)
--------cytoscape.py(32KB)
--------biom.py(16KB)
--------blast.py(8KB)
--------homology.py(3KB)
--------plots.py(22KB)
--------fasta.py(3KB)