drosophila_activity_analysis:用于(相对)快速分析通过Trikinetics DAM系统收集的屏幕数据的工具

时间:2021-05-15 11:50:20
【文件属性】:
文件名称:drosophila_activity_analysis:用于(相对)快速分析通过Trikinetics DAM系统收集的屏幕数据的工具
文件大小:16KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-15 11:50:20
Python drosophila_activity_analysis 作者:William Rowell 该代码处理并分析DAM(果蝇活动监视器)数据,并提供睡眠/活动图以及Excel可读格式的数据。 该代码包含一组函数,这些函数用于读取Trikinetics DENM(果蝇环境监视器)和DAM(果蝇活动监视器)数据格式,按基因型进行汇总,识别死蝇,识别睡眠发作,绘图以及保存数据。 系统范围的参数和实验参数被编码在两个单独的配置样式ini文件中。 文件类型 有四种基本输入文件类型: config_file , key_file ,DEnM文件和DAM文件: config_file是一个ini文件,其中包含全局配置值,例如已知环境监视器(DEnM)的数量和最高已知监视器的数量。 包含示例config.ini 。 key_file是一个ini文件,其中包含实验配置值,例如控制基因型,点亮时间和飞
【文件预览】:
drosophila_activity_analysis-master
----example_experiment.ini(1KB)
----config.ini(235B)
----analyze.py(8KB)
----file_io.py(10KB)
----__init__.py(40B)
----LICENSE(2KB)
----README.md(4KB)
----bash_profile_template(153B)
----process_experiment.py(5KB)
----.gitignore(770B)
----plot.py(7KB)

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