文件名称：superFreq:癌症外显子组分析流程
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更新时间：2024-05-23 06:05:45
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预印本： : Plos计算生物学： ://journals.plos.org/ploscompbiol/article?id 10.1371/journal.pcbi.1007603 超频率 SuperFreq是一个R软件包，用于分析癌症外显子组。 它有什么作用？ SuperFreq分析和过滤体细胞SNV和短indel，调用拷贝号并跟踪同一个人的多个样本上的克隆。 它识别每个克隆中的拷贝数变化和点突变，并通过变异注释和COSMIC突出显示可能引起突变的基因。 我该如何运行？ 开始R # first install superFreq if running first time # load devtools that allows installation from github (may need to install devtools first with instal