文件名称：CompoHeatMap:使用 ggplot2 创建与其他条形图组成的漂亮热图的 R 代码
文件大小：62KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-26 13:12:56
R
复合热图 使用 ggplot2 创建由其他条形图组成的漂亮热图的 R 代码。 特征： (1) 使用 ggplot2，这意味着绘图看起来不错，可以通过添加额外的 ggplot2 函数进行调整。 (2) 热图中的行和列可以通过指定分割高度的线段在视觉上进行分割，在该高度处切割聚类它们的树状图。 聚类可以在创建绘图的同一命令中完成，也可以单独完成。 (3) 能够创建复杂的组合图，其中包含多种类型的边缘信息（例如，样本来源、大小等），由与热图行正确对齐的条形图表示。 代码： compoHeatMap.R：包含所有功能。 （没有太多的错误检查。） test.CHmap.R：一系列示例/演示。 有关 test.CHmap.R 输出的 pdfs 文件，请参阅 tests.outdir 目录。 已知错误：测试代码在使用 Rscript 运行时（即在解释器之外）创建了一个空的 Rplots
【文件预览】：
CompoHeatMap-master
----test.CHmap.R(9KB)
----tests.outdir()
--------out.test5.bars_and_continuous_colorstacks.pdf(7KB)
--------out.test4.hmap.splits.colors.pdf(14KB)
--------out.test7.hmap.compos.w.bars.colorstacks.pdf(10KB)
--------out.test3.gg.dendro.pdf(7KB)
--------out.test1.main.pdf(6KB)
--------out.test6.discrete_colorstacks.pdf(6KB)
--------out.test2.main.pdf(6KB)
----README.md(2KB)
----compoHeatMap.R(36KB)