CompoHeatMap:使用 ggplot2 创建与其他条形图组成的漂亮热图的 R 代码

时间:2021-06-06 19:26:16
【文件属性】:
文件名称:CompoHeatMap:使用 ggplot2 创建与其他条形图组成的漂亮热图的 R 代码
文件大小:62KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-06-06 19:26:16
R 复合热图 使用 ggplot2 创建由其他条形图组成的漂亮热图的 R 代码。 特征: (1) 使用 ggplot2,这意味着绘图看起来不错,可以通过添加额外的 ggplot2 函数进行调整。 (2) 热图中的行和列可以通过指定分割高度的线段在视觉上进行分割,在该高度处切割聚类它们的树状图。 聚类可以在创建绘图的同一命令中完成,也可以单独完成。 (3) 能够创建复杂的组合图,其中包含多种类型的边缘信息(例如,样本来源、大小等),由与热图行正确对齐的条形图表示。 代码: compoHeatMap.R:包含所有功能。 (没有太多的错误检查。) test.CHmap.R:一系列示例/演示。 有关 test.CHmap.R 输出的 pdfs 文件,请参阅 tests.outdir 目录。 已知错误:测试代码在使用 Rscript 运行时(即在解释器之外)创建了一个空的 Rplots
【文件预览】:
CompoHeatMap-master
----test.CHmap.R(9KB)
----tests.outdir()
--------out.test5.bars_and_continuous_colorstacks.pdf(7KB)
--------out.test4.hmap.splits.colors.pdf(14KB)
--------out.test7.hmap.compos.w.bars.colorstacks.pdf(10KB)
--------out.test3.gg.dendro.pdf(7KB)
--------out.test1.main.pdf(6KB)
--------out.test6.discrete_colorstacks.pdf(6KB)
--------out.test2.main.pdf(6KB)
----README.md(2KB)
----compoHeatMap.R(36KB)

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