文件名称：Twister-DACIDR:这是在Twister中实现的DACIDR的当前管道
文件大小：42.26MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-02 20:00:44
Java
如何使用Twister-0.9运行DACIDR 获得对Linux环境机器的访问权限 按照以下步骤设置Twister-0.9环境：[ ] 将dacidr下的类导出到jar文件中（使用ANT），并将其放在$ TWISTER_HOME / apps下 复制除Twister-0.9.jar以外的lib文件夹下的所有文件，并将其放在$ TWISTER_HOME / lib下 运行应用程序 请参阅以下文档：[ ] ## DACIDR中的应用程序DACIDR中有3个应用程序：全对序列比对（ASA），多维标度（MDS）和插值。 ASA位于软件包cgl.imr.samples.dacidr.pwa下 MDS位于软件包cgl.imr.samples.dacidr.wdasmacof下 Interpoaltion在软件包cgl.imr.samples.dacidr.inter下 运行这些应用程序的脚
【文件预览】：
Twister-DACIDR-master
----.gitignore(2KB)
----data()
--------4640_fasta.txt(521KB)
----src()
--------cgl()
----README.md(9KB)
----script()
--------mdsFileSplit.sh(3KB)
--------run_dasmacof_cg_mem.sh(3KB)
--------pwaFileSpliter.sh(3KB)
--------pwaMatrixMergerNoMap.sh(3KB)
--------pwaMul.sh(3KB)
--------randomWeights.sh(3KB)
----build.xml(790B)
----lib()
--------EDNAFULL_newformat(1KB)
--------biojava3-alignment-3.0.2-SNAPSHOT.jar(161KB)
--------jug-asl-2.0.0.jar(31KB)
--------biojava3-core-3.0.jar(247KB)
--------biojava3-genome-3.0.2-SNAPSHOT.jar(60KB)
--------biojava3-protmod-3.0.2-SNAPSHOT.jar(83KB)
--------biojava3-phylo-3.0.2-SNAPSHOT.jar(57KB)
--------MBF2Java.jar(18KB)
--------biojava3-aa-prop-3.0.2-SNAPSHOT.jar(12KB)
--------biojavawrapper.jar(11KB)
--------CogAliIndividualScoreMat.jar(38.53MB)
--------biojava3-ws-3.0.2-SNAPSHOT.jar(14KB)
--------biojava3-structure-gui-3.0.2-SNAPSHOT.jar(266KB)
--------biojava3-core-3.0.2-SNAPSHOT.jar(252KB)
--------guava-18.0.jar(2.15MB)
--------BLOSUM62_newformat(2KB)
--------biojava3-structure-3.0.2-SNAPSHOT.jar(662KB)
--------Twister-0.9.jar(196KB)
--------biojava3-alignment-3.0.jar(100KB)
----Setup.md(4KB)