scad:Brainhack MTL 2015

时间:2024-05-30 14:37:49
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文件名称:scad:Brainhack MTL 2015

文件大小:89.8MB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-05-30 14:37:49

Python

脊髓自动检测 Brainhack MTL 2015:针对MR图像自动检测脊髓的算法 该存储库旨在开发和测试新算法,以在MR体积的各种对比下自动检测脊髓。 开发的算法必须满足以下条件: 它们可以用Python或C ++编码 他们必须读取nifti图像作为输入图像(.nii或.nii.gz):“-i”(输入文件名)选项 他们必须输出与输入图像相同格式和方向的二进制图像,其中包含脊髓的位置或中心线:“-o”(输出文件名)选项 它们必须具有冗长的选项'-v',该选项在此过程中显示一些有用的信息。 默认情况下,此选项处于禁用状态。 他们必须快 要验证新算法,它必须使用以下命令通过验证管道: scad_validation.py 验证管道会在整个测试数据集中测试您的算法,其中包含许多具有不同对比度,分辨率和视场的脊髓图像,以及它们的手动分段。 它测试以下几个条件


【文件预览】:
scad-master
----.gitignore(285B)
----data()
--------t2star()
--------gre()
--------t1()
--------dmri()
--------t2()
----LICENSE(1KB)
----scripts()
--------sct_process_segmentation.py(29KB)
--------sct_orientation.py(11KB)
--------msct_base_classes.py(2KB)
--------sct_smooth_spinalcord.py(10KB)
--------msct_image.py(22KB)
--------msct_smooth.py(29KB)
--------sct_label_utils.py(31KB)
--------scad.py(16KB)
--------scad_vesselness_filter.py(8KB)
--------sct_extract_spinal_levels.py(10KB)
--------sct_apply_transfo.py(12KB)
--------msct_nurbs.py(24KB)
--------sct_utils.py(29KB)
--------msct_parser.py(32KB)
--------sct_vertebral_detection.py(15KB)
--------msct_types.py(4KB)
--------SpinalCordDetection()
--------scad_validation.py(10KB)
--------sct_vesselness(28.93MB)
--------batch_labeling.py(54KB)
--------sct_straighten_spinalcord.py(47KB)
--------sct_crop_image.py(14KB)
----README.md(2KB)

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