文件名称：scvis:用于SCVIS库的R包装器
文件大小：1.29MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-21 20:09:16
Python
斯维斯 scvis是scvis python软件包的包装，用于减少高维生物学数据（尤其是单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据）的维数。 它改编自 。 依存关系： 张量流> = 1.1 PyYAML> = 3.11 matplotlib> = 1.5.1 numpy的> = 1.11.1 熊猫> = 0.19.1 运行scvis 1， train功能 train功能可用于学习概率参数映射（输入文件的确切目录应根据它们在计算机系统中的实际位置而改变）： scvis_train( sce , output_dir , sce_assay = " logcounts " , use_reducedDim = FALSE , reducedDim_name = NULL , config_file = NULL , data_label_file
【文件预览】：
scvis-master
----.gitignore(49B)
----NAMESPACE(31B)
----vignettes()
--------costs.png(65KB)
--------scvis_results.png(113KB)
--------refs.ris(1KB)
--------scvis-vignette.Rmd(3KB)
--------document.pdf(209KB)
----R()
--------scvis_train.R(4KB)
--------scvis_map.R(3KB)
--------utils.R(488B)
--------scvis_get_obj_func_results.R(1KB)
----data()
--------example_sce.RData(19.41MB)
----.Rbuildignore(28B)
----man()
--------scvis_map.Rd(1KB)
--------scvis_get_obj_func_results.Rd(509B)
--------scvis_train.Rd(1KB)
----README.md(3KB)
----inst()
--------python()
----scvis.Rproj(356B)
----DESCRIPTION(770B)
----scvis_report.pdf(212KB)