文件名称：scvis:用于减少高维生物数据维数的Python软件包
文件大小：60.28MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-06 13:41:33
Python
scvis是一个python软件包，用于减少高维生物学数据（尤其是单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据）的维数。 执照 scvis是免费的，可用于学术/非营利组织。 版本号 0.1.0 安装 要安装scvis，请确保已安装必需的库（如下）。 之后，可以从终端安装scvis： # In terminal python setup.py install 依存关系： 张量流> = 1.1 PyYAML> = 3.11 matplotlib> = 1.5.1 numpy的> = 1.11.1 熊猫> = 0.19.1 如何使用 安装scvis后，可以使用scvis命令。 1， train功能 train功能可用于学习概率参数映射（输入文件的确切目录应根据它们在计算机系统中的实际位置而改变）： # In terminal scvis train --data_matrix_
【文件预览】：
scvis-master
----lib()
--------scvis()
----LICENCE(0B)
----setup.py(556B)
----README.md(4KB)
----scvis(3KB)
----data()
--------synthetic_2d_2200_label.tsv(4KB)
--------synthetic_2d_22000.tsv(888KB)
--------synthetic_2d_2200.tsv(87KB)
--------synthetic_2d_22000_label.tsv(163KB)
--------retina_pca100_bipolar.tsv(76.63MB)
--------bipolar_label.tsv(58KB)
--------bipolar_pca100.tsv(47.12MB)
--------synthetic_9d_2200.tsv(385KB)
--------synthetic_9d_22000.tsv(3.78MB)
--------retina_label.tsv(129KB)