【文件属性】：
文件名称：scvis:用于减少高维生物数据维数的Python软件包
文件大小：60.28MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-17 19:54:53
Python
scvis是一个python软件包，用于减少高维生物学数据（尤其是单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据）的维数。
执照
scvis是免费的，可用于学术/非营利组织。
版本号
0.1.0
安装
要安装scvis，请确保已安装必需的库（如下）。 之后，可以从终端安装scvis：
# In terminal
python setup.py install
依存关系：
张量流> = 1.1
PyYAML> = 3.11
matplotlib> = 1.5.1
numpy的> = 1.11.1
熊猫> = 0.19.1
如何使用
安装scvis后，可以使用scvis命令。
1， train功能
train功能可用于学习概率参数映射（输入文件的确切目录应根据它们在计算机系统中的实际位置而改变）：
# In terminal
scvis train --data_matrix_
【文件预览】：
scvis-master
----lib()
--------scvis()
----LICENCE(0B)
----setup.py(556B)
----README.md(4KB)
----scvis(3KB)
----data()
--------synthetic_2d_2200_label.tsv(4KB)
--------synthetic_2d_22000.tsv(888KB)
--------synthetic_2d_2200.tsv(87KB)
--------synthetic_2d_22000_label.tsv(163KB)
--------retina_pca100_bipolar.tsv(76.63MB)
--------bipolar_label.tsv(58KB)
--------bipolar_pca100.tsv(47.12MB)
--------synthetic_9d_2200.tsv(385KB)
--------synthetic_9d_22000.tsv(3.78MB)
--------retina_label.tsv(129KB)