文件名称：taxmaps:NGS数据的超高效分类学映射
文件大小：297KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-23 08:10:32
Python
taxMaps taxMaps是一种超高效，可定制且完全可扩展的分类学分类工具，用于处理短时读取的数据，旨在处理大型DNA / RNA宏基因组学样本。 它的性能和全面性使其非常适合大规模测序操作中的无偏污染检测，包含大量样品的微生物组研究以及分析传递时间是关键因素的应用，例如从临床或环境样品中鉴定病原体。 版本：0.2 作者：Andre Corvelo taxMaps可免费用于学术和非商业研究目的（ ）。 特征 灵活的输入.bam ， .fastq （压缩/未压缩，是否交错）或任何将.fastq流式.fastq到STDOUT自定义命令 彻底的预处理-质量修整，移除多个适配器，硬修整（5'和3'），低复杂度过滤器。 映射优先级排序-通过使用多个自定义索引（对引入和主机减法有用）。 Performance-taxMaps充分利用了的出色功能和性能。 当使用预压缩索引时，该最新的比
【文件预览】：
taxmaps-master
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