Flye:De Novo汇编程序,用于使用重复图进行单分子测序读取

时间:2024-06-01 11:23:16
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文件名称:Flye:De Novo汇编程序,用于使用重复图进行单分子测序读取

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更新时间:2024-06-01 11:23:16

C++

Flye汇编器 版本:2.8.3 Flye是从头组装的单分子测序读物,例如PacBio和Oxford Nanopore Technologies生产的读物。 它设计用于各种数据集,从小型细菌项目到大型哺乳动物规模的装配体。 该软件包代表了一条完整的管道:它将原始的PacBio / ONT读入作为输入,并输出经过修饰的重叠群。 Flye还具有特殊的元基因组组装模式。 说明书 最新更新 Flye 2.8.3版本(2021年2月10日) 减少某些超长ONT数据集的RAM消耗 修复了一些ONT数据集上的罕见人工序列插入 组件应与2.8大致相同 Flye 2.8.2版本(2020年12月12日) GFA输出的改进,大而纠结的图形的生成速度大大提高 图简化算法的速度改进 修复了一些小错误 组件应与2.8大致相同 Flye 2.8.1版本(2020年9月2日) 添加了新选项--hifi-erro


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