文件名称：Illumina450K-methylation:从IDAT到Beta
文件大小：691KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-21 13:39:34
R
Illumina 450K甲基化分析 此R代码使用和将ILLUMINA 450K从预处理为经过过滤和标准化的beta值。 分析包括读取450K idat文件，通过detectionP和Nbead过滤的样品和探针，使用BMIQ归一化的II型探针，使用准备好的列表除去交叉探针和snp探针以及包括PCA，PVCA等的QC图。 也许现在还不完美！ 更多的中文细节可以在找到。 另一个有用的软件包也可以用于Illumina450K分析。 演示数据可以从下载。
【文件预览】：
Illumina450K-methylation-master
----README.md(906B)
----R()
--------pvca2_for450K_pipeline.R(6KB)
--------pvca1_for450K_pipeline.R(6KB)
--------450K_pipeline.R(4KB)
--------pca_for450K_pipeline.R(556B)
----data()
--------GSE66210_tec_trait.csv(917B)
--------list167085_for45Kfilter.csv(1.75MB)
--------GSE66210_RAW()